Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AtrnQ9WU60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AtrnQ9WU60 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AtrnQ9WU60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AtrnQ9WU60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms