Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrf1Q9WU00 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nrf1Q9WU00 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms