Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psma4Q9R1P0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma4Q9R1P0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma4Q9R1P0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms