Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rfwd2Q9R1A8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfwd2Q9R1A8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rfwd2Q9R1A8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rfwd2Q9R1A8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms