Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntn3Q9R1A3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntn3Q9R1A3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 549.8 ms