Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrpxQ9R0M3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms