Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Plod3Q9R0E1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plod3Q9R0E1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod3Q9R0E1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms