Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb1bp2Q9R000 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb1bp2Q9R000 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb1bp2Q9R000 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1bp2Q9R000 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1bp2Q9R000 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1bp2Q9R000 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1bp2Q9R000 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb1bp2Q9R000 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms