Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Npas3Q9QZQ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Npas3Q9QZQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms