Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a3Q9QZB6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr4a3Q9QZB6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr4a3Q9QZB6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr4a3Q9QZB6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms