Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd4Q9QY39 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pdzd4Q9QY39 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.7 ms