Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp3Q9QY23 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkp3Q9QY23 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pkp3Q9QY23 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms