Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copg2Q9QXK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg2Q9QXK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg2Q9QXK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg2Q9QXK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms