Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apbb1Q9QXJ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apbb1Q9QXJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Apbb1Q9QXJ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms