Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Limd1Q9QXD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Limd1Q9QXD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Limd1Q9QXD8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms