Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chaf1aQ9QWF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chaf1aQ9QWF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chaf1aQ9QWF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms