Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mid2Q9QUS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mid2Q9QUS6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mid2Q9QUS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms