Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tlr4Q9QUK6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tlr4Q9QUK6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms