Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdkl2Q9QUK0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdkl2Q9QUK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkl2Q9QUK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms