Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PolkQ9QUG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PolkQ9QUG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PolkQ9QUG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PolkQ9QUG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms