Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dclk1Q9JLM8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dclk1Q9JLM8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dclk1Q9JLM8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms