Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SacsQ9JLC8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SacsQ9JLC8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SacsQ9JLC8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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