Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FancaQ9JL70 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FancaQ9JL70 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FancaQ9JL70 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FancaQ9JL70 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FancaQ9JL70 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FancaQ9JL70 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FancaQ9JL70 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FancaQ9JL70 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FancaQ9JL70 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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