Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gde1Q9JL56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gde1Q9JL56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gde1Q9JL56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gde1Q9JL56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms