Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmgn5Q9JL35 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hmgn5Q9JL35 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hmgn5Q9JL35 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hmgn5Q9JL35 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms