Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccr10Q9JL21 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccr10Q9JL21 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms