Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx5Q9JKQ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx5Q9JKQ4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx5Q9JKQ4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms