Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nova1Q9JKN6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nova1Q9JKN6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Nova1Q9JKN6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nova1Q9JKN6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms