Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx6Q9JKK1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx6Q9JKK1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx6Q9JKK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx6Q9JKK1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx6Q9JKK1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx6Q9JKK1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx6Q9JKK1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx6Q9JKK1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx6Q9JKK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms