Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trem3Q9JKE1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trem3Q9JKE1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trem3Q9JKE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms