Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnq4Q9JK97 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcnq4Q9JK97 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnq4Q9JK97 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnq4Q9JK97 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms