Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pard6bQ9JK83 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pard6bQ9JK83 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms