Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msgn1Q9JK54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msgn1Q9JK54 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms