Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herpud2Q9JJC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Herpud2Q9JJC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms