Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup50Q9JIH2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup50Q9JIH2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup50Q9JIH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup50Q9JIH2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms