Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MkksQ9JI70 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MkksQ9JI70 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MkksQ9JI70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms