Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn12Q9ET43 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn12Q9ET43 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms