Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ4

Nckipsd, NCK-interacting protein with SH3 domain, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NckipsdQ9ESJ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NckipsdQ9ESJ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NckipsdQ9ESJ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NckipsdQ9ESJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms