Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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Ndst3Q9EQH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Ndst3Q9EQH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Ndst3Q9EQH7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Ndst3Q9EQH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndst3Q9EQH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Ndst3Q9EQH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndst3Q9EQH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndst3Q9EQH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Ndst3Q9EQH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndst3Q9EQH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Ndst3Q9EQH7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Ndst3Q9EQH7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Ndst3Q9EQH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Ndst3Q9EQH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndst3Q9EQH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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