Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsc1Q9EP53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsc1Q9EP53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsc1Q9EP53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms