Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rnft1Q9DCN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnft1Q9DCN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms