Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan4Q9DCK3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan4Q9DCK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms