Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xab2Q9DCD2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xab2Q9DCD2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Xab2Q9DCD2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.8 ms