Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Csnk1dQ9DC28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csnk1dQ9DC28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csnk1dQ9DC28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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