Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ergic1Q9DC16 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ergic1Q9DC16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms