Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Swt1Q9DBQ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Swt1Q9DBQ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Swt1Q9DBQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms