Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtr1Q9DBC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cmtr1Q9DBC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cmtr1Q9DBC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms