Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Med27Q9DB40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med27Q9DB40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med27Q9DB40 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms