Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2aQ9DAR1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2aQ9DAR1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm2aQ9DAR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms