Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc54Q9DAL3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc54Q9DAL3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms